2）生物过滤系统的培养：生物过滤系统是指利用水中的硝化细菌，将海水中所含的有害的氨、亚肖酸盐转化为无害的无机氨和水。在水族箱中，生物过滤系统主要是由高效能的生物过滤球组成。生物过滤球是一种中空的、表面积很在的硬质塑料球体，可以容纳数目可观的硝化细菌依生（即硝化细菌以生物过滤球为栽体），并在上面生长繁殖，当海水流过时，水中的有机物就会被吸附，并进而转化成无害的硝酸盐，当硝化细菌的数量足够多时，生物过滤球就会变为一个个黑色球体，海水中的氨，亚硝酸盐就会降到最低水平。这就是系统的功能。生物过滤系统的培养有一定时间，在最初的4－6周，由于生物过滤球上硝化细菌数量太少，还不足以稳定海水水质这时为了早日扇动生物过滤系统，可在生化过滤箱中添加活硝化细菌作种并添加液态肥料（如鱼威宝）或有机物残屑，也可放一尾死鱼等来作为硝化细菌的营养液。当硝化细菌数量足够多时，其净化稳定水质的功能就明显地呈现出来。这时水族箱中的生物过滤系统硝化功能才算正常运转。生物过滤系统一旦正常运输后，海水中的有机物（如剩余饵料、鱼的排泄物等）都会被分解消化，使水质达到一种高性能的生态平衡，对海水鱼类的正常生存极为有益。安装了第一把生物过滤系统的海水鱼水族箱，应尽量不要在海水中泼洒药物（如硫酸铜、抗生素等），以免影响生物过滤系统的正常运行。这一点要特别注意。
    3）水质保养：海水鱼的饲养水温一般维持在26－32摄氏度，海水中的无脊椎动物如珊瑚、海葵等，饲养水温只能维持在26－30摄氏度，因此，海水鱼的水温多控制在28摄氏度左右，对鱼类、无脊椎动物饲养极为有利。若水温高于30摄氏度以上，海葵、太阳花、气泡珊瑚等容易萎缩，水中的氧气含量会下降，有毒物质含量会上升。所以水族箱水温的稳定是确保海水鱼健康的关键。海水的PH介于8.0－8.4，日常饲养中水的PH控制在8.2－8.4，当PH超过8.4时，应及时用二氧化碳扩散器向海水中缓缓补充二氧化碳，使水中的化学物质通过二氧化碳的散发挥发掉，使水的PH慢慢降低，此外，也可用米醋溶液予以调节，若水的PH低于8.0时，可及时用小共打溶液进行调整。海水的硬度应维持在7度－9度DH，当硬度降到5度DH以下时，应及时地KH提高锭调高硬度。水质硬度的降低表明海水的缓冲能力变弱，也直接影响到海水PH稳定，导致海水水质的不稳定。海水中的无脊椎动物，如珊瑚等，它们可以吸收水中的碳酸盐，使海水的硬度逐渐降低，因此，在饲养有无脊椎动物的水族箱中，若出现水质硬度经常降低的现象，可采用二氧化碳扩散器向海水中缓缓补充二氧化碳，作为无脊椎动物的营养，也可有效稳定水质的硬度。海水中的微量元素铁的含量应控制在0.05－0.10毫克/升，当水中铁含量过低时，应及时补充液态铁，微量元素铁参与海水中无脊椎的新陈代谢活动，可以保持鱼类色泽的艳丽。海水中氨、亚硝酸直的含量应控制在近乎无的状态。如若海水中的氨、亚硝酸盐出现了微小的含量，常表明水族箱中生物过滤系统负担过重，不能有效地硝化和分解海水中的氨和亚硝酸盐，这时应及时更换部分饲水，并减少投饵量。
    4）水质处理：海水观赏鱼水族箱中海水的过滤都是采用三级过滤，即机械过滤、化学过滤和生物过滤，水质的保养时间较长，一般不需要大批量的换水。海水水质的更换有两种形式：一是海水会有部分的蒸发，但这要经一段时间后才会逐渐显现出来。当水族箱中的水位降低到一定程度时，这时就应及时补充新水至原位，由于海水中出的水同温度陈化自来水或过滤水于水族箱中。二是海水中饲养鱼类后，水质会出现一些衰老的变化。为保持海水水质的稳定，日常饲养中可每周更换部分旧水，再中入先是同温度陈化自来水，同时用海水盐调整水的密度。